More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0434 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 317 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 		 317 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  99.37 
 
 		 317 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  84.23 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  53.59 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  58.5 
 
 		 318 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  58.5 
 
 		 318 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  46.08 
 
 		 345 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  46.08 
 
 		 346 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  45.82 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  45.74 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  38.41 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  43.26 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  39.86 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  40.34 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.34 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  38.37 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  39.86 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 357 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.87 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.2 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.89 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.87 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.87 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.98 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.05 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  36.74 
 
 		 359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  36.74 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  39.15 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.11 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.51 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.94 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.87 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.56 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  34.32 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.99 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.96 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.4 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0424  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.45 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.96 
 
 		 327 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.5 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.97 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  35.09 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.84 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.15 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  33.64 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.15 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  33.8 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.8 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.33 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>