More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0424 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0424  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  100 
 
 		 309 aa  591  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.8 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.8 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.46 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.46 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.57 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  34.41 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  37.08 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.12 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  33.21 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.79 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  34.27 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.23 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  32.88 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  30.93 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  32.88 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  30 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  32.88 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.06 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.45 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  31.35 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.26 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3252  inner-membrane translocator  33 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0683493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  32.12 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  30.25 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  31.21 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  31.89 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  29.02 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30.96 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  30.56 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 		 342 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.39 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  30.1 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  31.77 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  30.72 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  30.1 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>