More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5193 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 352 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  93.55 
 
 		 342 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  98.48 
 
 		 348 aa  587  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  88.29 
 
 		 339 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  58.12 
 
 		 353 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  56.41 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  54.17 
 
 		 328 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  54.73 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  55.1 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  55.1 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  48.81 
 
 		 341 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  42.64 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  45.87 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  40.37 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  34.17 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  38.62 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  38.62 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  38.62 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  35.86 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  35.15 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 		 311 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 		 311 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  30.62 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30.39 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30.39 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  30.27 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  30.27 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  29.74 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  29.74 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  29.93 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  30.26 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30.25 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  31.12 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  30.9 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  32.4 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  32.4 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  32.4 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  32.4 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  32.4 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  29.91 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  27.94 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  34.15 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  30.43 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  31.94 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  31.27 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  32.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  27.94 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  30.85 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  27.76 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  31.06 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  29.63 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>