More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4372 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  100 
 
 		 341 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  53.15 
 
 		 353 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  56.11 
 
 		 328 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  53.73 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  53.72 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  51.1 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  53.74 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  53.19 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  53.19 
 
 		 352 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  51.74 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  51.74 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  42.99 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  42.31 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.71 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  41.03 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  38.89 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  38.89 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  36.11 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  34.37 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  39.24 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  33.33 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  32.11 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  32.11 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  34.35 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.21 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.87 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  29.65 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  26.18 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  28.21 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.29 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.29 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  28.93 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  28.72 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  29.02 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0424  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  29.17 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  29.88 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  27.76 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.47 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.47 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.47 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  27.76 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  27.44 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.12 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2982  monosaccharide-transporting ATPase  37.87 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.018273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  33.67 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 835 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.61 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  34.69 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  28.88 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  30.59 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  30 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7808  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  29.51 
 
 		 348 aa  92.4  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  28.17 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  31.68 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  28.7 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  27.13 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 383 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  27.71 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  33.2 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  30.19 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  27.71 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  27.71 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>