More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8211 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 337 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  55.62 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1608  sugar ABC transporter, permease protein  53.37 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  52.35 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2371  sugar ABC transporter, permease protein  52.35 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474719  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1077  carbohydrate ABC transporter permease  52.35 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6918  Monosaccharide-transporting ATPase  55.15 
 
 		 351 aa  318  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182781  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1791  carbohydrate ABC transporter permease  52.35 
 
 		 350 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0639  sugar ABC transporter, permease protein  52.35 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55.48 
 
 		 349 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0827  carbohydrate ABC transporter permease  52.35 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1454  Monosaccharide-transporting ATPase  50.58 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4924  Monosaccharide-transporting ATPase  52.92 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.15 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.93 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.84 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.22 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  38.49 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.22 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  36.18 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.08 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.08 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.89 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  32.74 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  35.55 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.89 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.37 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.37 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.27 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  34.27 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  31.51 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  34.07 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.93 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1521  putative ribose ABC transporter permease  39.47 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.208852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2687  putative ribose ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000013058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  34.88 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  35.22 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2766  monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00071607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.19 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.38 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  32.92 
 
 		 315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.98 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  34.55 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  34.55 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  34.55 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  34.55 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  34.55 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.62 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  31.74 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.29 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.65 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>