More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2116 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 340 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1607  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.87 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.54 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1606  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.65 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  32.63 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.76 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.4 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.49 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.49 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 311 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.14 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.14 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.74 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.74 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  35.92 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1363  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.45 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  34.15 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  32.39 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.87 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  31.94 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 323 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.72 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  32.3 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  34.19 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.76 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  31.51 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.18 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.89 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  31.29 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  32.44 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  29.94 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.05 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.77 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.77 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.58 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.88 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0883  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>