More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1606 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1606  inner-membrane translocator  100 
 
 		 338 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1607  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  40.21 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.1 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.31 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.99 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.67 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.67 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.41 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.32 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  35.25 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.75 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.75 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.33 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  32.89 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  30.84 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  34.19 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  29.72 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  30.89 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.13 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 835 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.38 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.04 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.02 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  32.1 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.42 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.35 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.42 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  31.46 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.13 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  31.61 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  32.13 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  31.44 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  30.5 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  29.34 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.63 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.56 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  31.87 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  29.02 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.68 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  30.79 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.21 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.02 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  30.56 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  30.56 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>