More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1607 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1607  inner-membrane translocator  100 
 
 		 326 aa  628  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1606  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  37.02 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.8 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.58 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.14 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.96 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.62 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.62 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.27 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.27 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.39 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  35.99 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  35.91 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  36.81 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.83 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  34.71 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  31.8 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.48 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 		 347 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.88 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  35.02 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.3 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  32.08 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30.43 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  31.77 
 
 		 364 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.66 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.66 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.44 
 
 		 360 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.7 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.49 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.95 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  31.01 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30.54 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 		 334 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 		 334 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  30.55 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  33.02 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  31.5 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>