More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3219 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 331 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  92.15 
 
 		 331 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  92.15 
 
 		 331 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  92.15 
 
 		 331 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1661  inner-membrane translocator  90.33 
 
 		 331 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2416  inner-membrane translocator  86.27 
 
 		 335 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1932  inner-membrane translocator  90.03 
 
 		 331 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2316  inner-membrane translocator  88.22 
 
 		 331 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00754552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1136  inner-membrane translocator  85.2 
 
 		 331 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  49.24 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  52.65 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  52.96 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  48.74 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  48.11 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  47.8 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  42.01 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  40.72 
 
 		 348 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  42.07 
 
 		 352 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  40.85 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1257  inner-membrane translocator  46.62 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6575  inner-membrane translocator  46.62 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6180  monosaccharide-transporting ATPase  46.62 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282099 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6146  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  hitchhiker  0.00489124 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4829  monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 		 350 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.81 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5887  monosaccharide-transporting ATPase  37.82 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0742654  normal  0.67986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.12 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  37.79 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.92 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.19 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.83 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.8 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 376 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.92 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.1 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.25 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.6 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.91 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  31.63 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.28 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.28 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  35.41 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.43 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.84 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  34.47 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  35.1 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.17 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  35.83 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.06 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  35.08 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  34.18 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 331 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  34.01 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  33.64 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.65 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30.4 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>