More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0843 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 336 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  93.77 
 
 		 337 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  64.16 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  64.83 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  64.83 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  51.99 
 
 		 332 aa  345  5e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  52.96 
 
 		 331 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  52.02 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  52.02 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  52.02 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1136  inner-membrane translocator  50.94 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2416  inner-membrane translocator  48.24 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1932  inner-membrane translocator  50.89 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1661  inner-membrane translocator  50.89 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2316  inner-membrane translocator  51.25 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00754552  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  44.98 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  46.91 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  42.37 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6146  inner-membrane translocator  44.38 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  hitchhiker  0.00489124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  43.5 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6180  monosaccharide-transporting ATPase  48.44 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1257  inner-membrane translocator  48.44 
 
 		 353 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6575  inner-membrane translocator  48.44 
 
 		 353 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4829  monosaccharide-transporting ATPase  44.85 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5887  monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0742654  normal  0.67986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.13 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 324 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.66 
 
 		 350 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.84 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.35 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.33 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.65 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.74 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.03 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  35.35 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.54 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.2 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.86 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.93 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 835 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.55 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.81 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  34.28 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  32.63 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.91 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.65 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.72 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 		 353 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 345 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  30.7 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.01 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.02 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>