More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1932 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1661  inner-membrane translocator  98.79 
 
 		 331 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1932  inner-membrane translocator  100 
 
 		 331 aa  646    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  90.03 
 
 		 331 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  87.61 
 
 		 331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  87.61 
 
 		 331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  87.61 
 
 		 331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2416  inner-membrane translocator  90.15 
 
 		 335 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2316  inner-membrane translocator  90.63 
 
 		 331 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00754552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1136  inner-membrane translocator  84.59 
 
 		 331 aa  531  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  49.7 
 
 		 332 aa  316  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  51.36 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  50.89 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  47.98 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  47.35 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  47.04 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  42.18 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  43.31 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  42.15 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  39.82 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  42.3 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  44.2 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6180  monosaccharide-transporting ATPase  47.3 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1257  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6575  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6146  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  hitchhiker  0.00489124 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4829  monosaccharide-transporting ATPase  38.28 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5887  monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0742654  normal  0.67986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.75 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.78 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.52 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.9 
 
 		 312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.87 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  32.91 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.69 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.69 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.62 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.75 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.03 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.35 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.97 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.71 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.71 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.92 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.89 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  35.12 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  36.48 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  35.17 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.81 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 376 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.33 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.4 
 
 		 336 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.91 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.62 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.25 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  32.74 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2721  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  32.76 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  33.97 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>