More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3722 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  100 
 
 		 329 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  73.56 
 
 		 329 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  73.56 
 
 		 329 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  73.25 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  48.74 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3561  monosaccharide-transporting ATPase  49.32 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  42.76 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  42.76 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  41.06 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  43.31 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  41.67 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3637  monosaccharide-transporting ATPase  45.82 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1229  sugar ABC transporter permease  39.73 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.446632 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.86 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  33.23 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.41 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.02 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.02 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  33.33 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.75 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.77 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.77 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.77 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.77 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  35.63 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  35.63 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.75 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  32.82 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  35.83 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.85 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.11 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.06 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 322 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.11 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.45 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  35.82 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.11 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  35.1 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 		 835 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.7 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.99 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.77 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.2 
 
 		 322 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  31.82 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.11 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 345 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 345 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.1 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  34.44 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.67 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  34.74 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  34.74 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>