More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3637 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3637  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 333 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  78.92 
 
 		 342 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  77.81 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3561  monosaccharide-transporting ATPase  65.81 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  53.74 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  43.06 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  45.74 
 
 		 329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  45.74 
 
 		 329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  45.43 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  41.27 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  40.32 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1229  sugar ABC transporter permease  37.78 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.446632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  35.24 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4659  monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225069  normal  0.765727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  34.28 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5190  Monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.95 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.9 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.69 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.69 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.69 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.69 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.03 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1268  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.11 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.71 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.81 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  32.81 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  35.45 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.12 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.72 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.12 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4061  monosaccharide-transporting ATPase  35.81 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.35 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  30.82 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.02 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1338  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.63 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.28 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 835 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.11 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.96 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.11 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.96 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  33.12 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  32.72 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  32.81 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  32.81 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  32.81 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  32.81 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  32.81 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3318  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  30.79 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1405  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.46 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.26 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>