More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5887 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5887  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 348 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0742654  normal  0.67986 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4829  monosaccharide-transporting ATPase  90.46 
 
 		 350 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  74.07 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  60.74 
 
 		 341 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  51.45 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  53.2 
 
 		 352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1257  inner-membrane translocator  53.91 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6180  monosaccharide-transporting ATPase  53.91 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282099 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6575  inner-membrane translocator  53.91 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  51.01 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6146  inner-membrane translocator  51.44 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  hitchhiker  0.00489124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  45.29 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  43.93 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  43.75 
 
 		 329 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  43.12 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  43.12 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  38.84 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  40 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2416  inner-membrane translocator  38.53 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1136  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1661  inner-membrane translocator  39 
 
 		 331 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1932  inner-membrane translocator  39 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2316  inner-membrane translocator  40.12 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00754552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  31.71 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.97 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.43 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.23 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  34.4 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.41 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 338 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.22 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.49 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 835 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  31.22 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.91 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  30.11 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 339 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.61 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.61 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5008  Monosaccharide-transporting ATPase  32.83 
 
 		 346 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  31.12 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.03 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.04 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  30.88 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  33.85 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.46 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.83 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.02 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  28.73 
 
 		 354 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  32.41 
 
 		 345 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29.86 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.12 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.12 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.12 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32.05 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.8 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.15 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  31.04 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>