More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4829 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009672  Oant_4829  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
350 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5887  monosaccharide-transporting ATPase  90.46 
 
 
348 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0742654  normal  0.67986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  72.84 
 
 
336 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  61.04 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  52 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  54.39 
 
 
352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1257  inner-membrane translocator  60.14 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6180  monosaccharide-transporting ATPase  60.14 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.282099 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6575  inner-membrane translocator  60.14 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425022  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6146  inner-membrane translocator  52.54 
 
 
349 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  hitchhiker  0.00489124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  52.02 
 
 
343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  45.02 
 
 
337 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  44.06 
 
 
329 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  43.93 
 
 
332 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  44.88 
 
 
361 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  45.26 
 
 
336 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  43.12 
 
 
331 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  43.12 
 
 
329 aa  241  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  38.42 
 
 
331 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  38.42 
 
 
331 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  38.42 
 
 
331 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  39 
 
 
331 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2416  inner-membrane translocator  38.55 
 
 
335 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1136  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
331 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2316  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
331 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00754552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1661  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1932  inner-membrane translocator  38.58 
 
 
331 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  30.65 
 
 
346 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.76 
 
 
327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.53 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  32.93 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  32.41 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.33 
 
 
310 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.53 
 
 
345 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 
340 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.02 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.75 
 
 
342 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.02 
 
 
314 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  30.68 
 
 
383 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.52 
 
 
345 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
346 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 
347 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.79 
 
 
350 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  31.49 
 
 
343 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  31.22 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
835 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5008  Monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.32 
 
 
353 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 
353 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.1 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.85 
 
 
306 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.25 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
341 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  31.99 
 
 
327 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.65 
 
 
327 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 
348 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  30.99 
 
 
339 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.59 
 
 
334 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.89 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2020  inner-membrane translocator  29.01 
 
 
397 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.232129  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 
337 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
310 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
311 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 
341 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
311 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  31.16 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.08 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.08 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.08 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  34.55 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  32.52 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  32.48 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.76 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  31.04 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  32.41 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.23 
 
 
322 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.54 
 
 
322 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.56 
 
 
334 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.72 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.43 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>