More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2214 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  100 
 
 		 324 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  57.93 
 
 		 328 aa  331  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  55.52 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  51.26 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2090  inner-membrane translocator  47.18 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  41.31 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  42.5 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  36.82 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  39.46 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  40.26 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.38 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.08 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  40.95 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  42.16 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  36.65 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  36.68 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  35.65 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  39.86 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  38.38 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  36.53 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  34.77 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 336 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  38.36 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.54 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.22 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.58 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  36.22 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  40 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.22 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  35.89 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.22 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  36.96 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.28 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  35.58 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  35.58 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  45.32 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  38.1 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.39 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  35.28 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 331 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 333 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  37.23 
 
 		 333 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.54 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  36.48 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  35.28 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  35.28 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  35.28 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  37.38 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  38.36 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  40.89 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.01 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.91 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  37.38 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  37.38 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  37.85 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  37.38 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  37.38 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  37.38 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  35.98 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.95 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  37.5 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  37.38 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>