More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2687 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2687  putative ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 332 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000013058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1521  putative ribose ABC transporter permease  99.1 
 
 		 332 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.208852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2766  monosaccharide-transporting ATPase  98.49 
 
 		 332 aa  630  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00071607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.54 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.15 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6918  Monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182781  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  33.33 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.66 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.85 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  35.69 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.1 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1608  sugar ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2371  sugar ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.13 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1077  carbohydrate ABC transporter permease  36.36 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  37.41 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.36 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.58 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.56 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0639  sugar ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0827  carbohydrate ABC transporter permease  36.36 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.63 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  40.73 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1791  carbohydrate ABC transporter permease  36.36 
 
 		 350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.63 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.05 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.71 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.98 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.98 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 835 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  32.56 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  32.56 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  32.98 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.81 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.76 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.49 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.54 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.46 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.33 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  32.94 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  30.43 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  31.69 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.43 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>