More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2962 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 349 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6918  Monosaccharide-transporting ATPase  94.59 
 
 		 351 aa  554  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182781  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  89.97 
 
 		 341 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1608  sugar ABC transporter, permease protein  86.21 
 
 		 341 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0639  sugar ABC transporter, permease protein  85.01 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2371  sugar ABC transporter, permease protein  85.01 
 
 		 341 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474719  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0827  carbohydrate ABC transporter permease  85.01 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  85.01 
 
 		 350 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1077  carbohydrate ABC transporter permease  85.01 
 
 		 341 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255506  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1791  carbohydrate ABC transporter permease  85.01 
 
 		 350 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  53.12 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1454  Monosaccharide-transporting ATPase  47.09 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4924  Monosaccharide-transporting ATPase  49 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  33.04 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  32.67 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  32.67 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  32.67 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  32.33 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1521  putative ribose ABC transporter permease  38.21 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.208852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2687  putative ribose ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000013058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.2 
 
 		 317 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2766  monosaccharide-transporting ATPase  37.87 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00071607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.04 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  33.12 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.33 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.01 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.6 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  32.24 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  31.1 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.32 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.94 
 
 		 334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  29.94 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.87 
 
 		 323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.8 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32.93 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.66 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  32.61 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.99 
 
 		 331 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  31.85 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3429  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00479151  hitchhiker  0.0000975841 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.95 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  33.85 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.16 
 
 		 324 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.61 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  32.16 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.68 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 		 835 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.68 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  34.04 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  31.1 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.56 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.65 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.54 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  33.81 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  33.81 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  33.81 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>