More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0639 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0639  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 341 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2371  sugar ABC transporter, permease protein  99.71 
 
 		 341 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474719  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0827  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 		 341 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  99.71 
 
 		 350 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1077  carbohydrate ABC transporter permease  99.71 
 
 		 341 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255506  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1791  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 		 350 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1608  sugar ABC transporter, permease protein  95.89 
 
 		 341 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  87.32 
 
 		 341 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6918  Monosaccharide-transporting ATPase  90.64 
 
 		 351 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182781  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  90.97 
 
 		 349 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  52.35 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4924  Monosaccharide-transporting ATPase  48.97 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1454  Monosaccharide-transporting ATPase  46.53 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  32.09 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  32.09 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  32.09 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.11 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  31.76 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.3 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.17 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  34.25 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.3 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.16 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  34.06 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.91 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1521  putative ribose ABC transporter permease  36.52 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.208852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  34.27 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2687  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000013058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.26 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.62 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  30.67 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.27 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  31.15 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2766  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00071607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  36.68 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  31.6 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 835 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30.82 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  36.05 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.86 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.01 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 321 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 321 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 321 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 321 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 321 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  33.02 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.01 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  31.1 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  33.64 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  30.84 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  35.05 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  31.43 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3429  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00479151  hitchhiker  0.0000975841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  31.1 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  30.8 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  34.11 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>