More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1209 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  100 
 
 
328 aa  637    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  39.57 
 
 
326 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  39.24 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  35.58 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  30.88 
 
 
373 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  34.33 
 
 
344 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 
328 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  34.71 
 
 
340 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
342 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 
373 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
353 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  34.1 
 
 
385 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
353 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  31.94 
 
 
352 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  38.35 
 
 
322 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
344 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  29 
 
 
376 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  31.67 
 
 
352 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  32.82 
 
 
352 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  31.18 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  34.35 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  33.54 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  32.64 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
375 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
358 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
333 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 
311 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
311 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  29.74 
 
 
385 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  30.96 
 
 
350 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.94 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.94 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.94 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.94 
 
 
311 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  31.37 
 
 
347 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.79 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  31.19 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  31.63 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.08 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  30.32 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.12 
 
 
345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.55 
 
 
315 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  31.29 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  32.92 
 
 
349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  32.32 
 
 
355 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  29.82 
 
 
359 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  34.34 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.87 
 
 
345 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  29.75 
 
 
350 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.58 
 
 
345 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
332 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  30.95 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  32.24 
 
 
347 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.89 
 
 
324 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  30.89 
 
 
332 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
332 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
339 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 
339 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 
322 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
332 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  30.57 
 
 
325 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
347 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33 
 
 
317 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  31.11 
 
 
333 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 
332 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 
336 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  31.15 
 
 
335 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.89 
 
 
332 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  30.89 
 
 
332 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  32.34 
 
 
341 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  29.84 
 
 
326 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  28.36 
 
 
406 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  30.89 
 
 
332 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
332 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  31.15 
 
 
335 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  31.03 
 
 
326 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  32.55 
 
 
333 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1375  inner-membrane translocator  32.59 
 
 
336 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.22 
 
 
339 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.21 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>