More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1807 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  100 
 
 
352 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  60.52 
 
 
350 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  60.87 
 
 
352 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  62.39 
 
 
352 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  60.06 
 
 
352 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  63.01 
 
 
353 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  62.35 
 
 
352 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  63.14 
 
 
353 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  58.6 
 
 
349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  58.82 
 
 
355 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  59.15 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  63.95 
 
 
357 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  52.91 
 
 
344 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  53.7 
 
 
346 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  50.46 
 
 
342 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  46.9 
 
 
347 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  43.87 
 
 
340 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 
385 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  41.19 
 
 
344 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  43.61 
 
 
344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  40.36 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  38.21 
 
 
376 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  38.55 
 
 
373 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 
375 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 
375 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  36.93 
 
 
406 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  38.97 
 
 
391 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  34.79 
 
 
373 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  36.6 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  37.61 
 
 
385 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.66 
 
 
374 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  36.66 
 
 
381 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  36.66 
 
 
381 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  36.66 
 
 
381 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  36.66 
 
 
381 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  36.66 
 
 
381 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  36.66 
 
 
381 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  36.87 
 
 
373 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.39 
 
 
385 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  37.4 
 
 
385 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  31.94 
 
 
328 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 
328 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 
326 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  30.41 
 
 
355 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  31.03 
 
 
334 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  30.63 
 
 
342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  32 
 
 
322 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  25.83 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  26.77 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  27.24 
 
 
357 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  27.27 
 
 
353 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 
353 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 
332 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  25.99 
 
 
350 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.61 
 
 
333 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 
332 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  28.24 
 
 
324 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  27.27 
 
 
360 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  31.93 
 
 
320 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  30.15 
 
 
332 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 
332 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 
332 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  30.18 
 
 
354 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  26.71 
 
 
363 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  27.6 
 
 
364 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  27.33 
 
 
405 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.46 
 
 
332 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  30.46 
 
 
332 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
332 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  30.46 
 
 
332 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  27.41 
 
 
346 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  26.71 
 
 
328 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  27.97 
 
 
335 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  27.46 
 
 
360 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  28.7 
 
 
326 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  26.45 
 
 
350 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  29.73 
 
 
315 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
346 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  26.37 
 
 
341 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  28.42 
 
 
383 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  27.68 
 
 
335 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  28.53 
 
 
332 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  27.56 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  25.41 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  28.82 
 
 
861 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  27.33 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  32.59 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  29.47 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  28 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4777  Monosaccharide-transporting ATPase  28.38 
 
 
311 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.21 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  28.98 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  26.45 
 
 
332 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.45 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  25 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>