More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0655 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  100 
 
 		 350 aa  683    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  60.97 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  63.22 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  62.99 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  60.11 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  58.86 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  59.65 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  60.52 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  57.02 
 
 		 352 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  61.75 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  60.56 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  60.55 
 
 		 357 aa  391  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  56.79 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  52.52 
 
 		 346 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  54.22 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  47.89 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  41.93 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 373 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 		 385 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 376 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  38.35 
 
 		 391 aa  209  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 		 375 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  35.75 
 
 		 385 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  37.96 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  37.96 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  37.96 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  37.96 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  37.96 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  37.96 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.96 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  34.25 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.6 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  34.24 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 357 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  28.9 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.76 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 326 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  27.45 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.27 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  28.41 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  30.17 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  31.46 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  27.76 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.34 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  28.53 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  29.49 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 347 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 322 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.02 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  28.23 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  29.68 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  32.08 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.24 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  28.74 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.33 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  29.1 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  29.39 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.45 
 
 		 322 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  28.43 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  28 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.97 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  27.5 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  26.97 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  27.32 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>