More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1359 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  100 
 
 		 352 aa  700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  81.25 
 
 		 352 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  77.56 
 
 		 352 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  76.99 
 
 		 352 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  63.08 
 
 		 348 aa  454  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  63.53 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  64.29 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  65.26 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  57.02 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  65.14 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  60.06 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  57.74 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  51.47 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  54.66 
 
 		 346 aa  341  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  50.6 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  52.52 
 
 		 342 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  40.12 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  37.4 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  39.44 
 
 		 377 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  38.21 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  36.34 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  39.63 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  39.24 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 375 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 375 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  39.72 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  36.02 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  40.23 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  37.19 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.91 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  37.7 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  37.7 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  37.7 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  37.7 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  37.7 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  37.7 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.7 
 
 		 374 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 		 381 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  32.09 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  28.86 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  29.63 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  28.04 
 
 		 405 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  32.59 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  27.76 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  26.8 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  30.24 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  28.49 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  27.4 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  29.07 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0158  monosaccharide-transporting ATPase  27.68 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  28.31 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  27.22 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  29.17 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  28.39 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.16 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  27.57 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  27.41 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  27.57 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  27.36 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  27.85 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  29.68 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  26.57 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  28.13 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  26.87 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0774  Monosaccharide-transporting ATPase  27.93 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  30.42 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  28.61 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  29.04 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  29.53 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3278  monosaccharide-transporting ATPase  30.99 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.990654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  30.65 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  28.62 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>