More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2771 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  100 
 
 		 353 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  66.29 
 
 		 353 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  71.82 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  61.93 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  63.07 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  62.86 
 
 		 352 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  62.22 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  61.05 
 
 		 349 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  59.89 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  60.68 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  59.65 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  59.21 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  53.51 
 
 		 344 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  51.75 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  47.55 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  43.62 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  36.6 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  45.26 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  39.69 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  38.01 
 
 		 373 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  40.11 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 344 aa  212  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 391 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  36.96 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  37.17 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  37.17 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  37.17 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  37.17 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  37.17 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  37.17 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.17 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  35.24 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  32.98 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  27.68 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  28.77 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.2 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.53 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.71 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3273  putative ABC transporter, permease protein,y4mJ-like protein  31.66 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.715289  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  30.75 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  30.56 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  29.17 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  27.86 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  29 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.91 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  29.32 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  27.35 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  27.73 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  28.71 
 
 		 357 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  32.02 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.86 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  28.15 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1375  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  25.92 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  30.21 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  29.31 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  28.02 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  30.03 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  28.17 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  28.28 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 335 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>