More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4850 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 373 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  75 
 
 		 376 aa  552  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  77.16 
 
 		 375 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  76.88 
 
 		 375 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  69.11 
 
 		 373 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  71.87 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  67.92 
 
 		 385 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  65.29 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  52.7 
 
 		 385 aa  352  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  52.57 
 
 		 381 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  52.03 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  52.03 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  52.03 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  52.03 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  52.03 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  52.03 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  54.6 
 
 		 385 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  52.03 
 
 		 374 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  54.04 
 
 		 385 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 373 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  52.04 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 406 aa  308  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  48.33 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 344 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  46.69 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  39.95 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  45.72 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 353 aa  219  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 350 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 348 aa  205  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 353 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  29.63 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  29.52 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 326 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.18 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  26.68 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.5 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.79 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  30.5 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.73 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.5 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  29.28 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  26.91 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  29.94 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  29.94 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  28.18 
 
 		 394 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  28.18 
 
 		 394 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.25 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  27.58 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  30.28 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  31.76 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  30 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  28.45 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  27.58 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  27.9 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.19 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  25.78 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  27.14 
 
 		 333 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  28.11 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  29.55 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  29.28 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  29.46 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.03 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  27.65 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>