More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2472 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 347 aa  675    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  50.74 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 352 aa  335  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  50.6 
 
 		 352 aa  332  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  51.18 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  53.82 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  52.82 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  48.98 
 
 		 352 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  50.45 
 
 		 352 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  52.24 
 
 		 353 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  48.69 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  52.44 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  47.89 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  48.77 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 352 aa  292  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  46.91 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  45.64 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  38.32 
 
 		 385 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  40.72 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  40.72 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  40.72 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  40.72 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  40.72 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  40.72 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  40.72 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  39.34 
 
 		 376 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  43.47 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  37.17 
 
 		 374 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  40.5 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  38.23 
 
 		 385 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  35 
 
 		 373 aa  208  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  37.88 
 
 		 385 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.88 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 385 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  31.74 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.31 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.99 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  31.38 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  28.25 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.66 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 383 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  29.18 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.31 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  30.15 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.31 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  30.33 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  30.13 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  28.26 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.72 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.44 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  28.78 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  28.53 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  29.14 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  27.99 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  29.14 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  28.65 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  28.85 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  28.27 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  29.14 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  26.21 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1363  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  29.46 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>