More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6226 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 333 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  87.31 
 
 		 332 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  64.65 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  60.25 
 
 		 324 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  51.59 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  36.55 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.12 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.87 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 348 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.33 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.12 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.08 
 
 		 327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0883  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  32.8 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  31.69 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  30.46 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  31.91 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3267  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.322146  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.09 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0055  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 363 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.72 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.74 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  31.19 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  31.19 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.35 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.35 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  30.37 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  33.72 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.9 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.45 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.99 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 314 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  33.9 
 
 		 338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  32.12 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  32.22 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.38 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  32.05 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  29.13 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.05 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.22 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>