More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3408 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 334 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  97.9 
 
 		 334 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  88.69 
 
 		 336 aa  550  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3407  monosaccharide-transporting ATPase  78.19 
 
 		 333 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0543  ribose ABC transporter, permease protein  78.5 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0696377  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0545  ribose ABC transporter, permease protein  78.5 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5264  monosaccharide-transporting ATPase  54.32 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3674  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  53.97 
 
 		 337 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765342  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0963  Monosaccharide-transporting ATPase  53.02 
 
 		 337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  49.54 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4770  inner-membrane translocator  50.32 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  50.79 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2908  inner-membrane translocator  51.27 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3273  inner-membrane translocator  51.4 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6150  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  50.96 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2684  monosaccharide-transporting ATPase  50.63 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2824  inner-membrane translocator  51.54 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  39.34 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1488  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  35.98 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.06 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.06 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.53 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.74 
 
 		 311 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.74 
 
 		 311 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.58 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.05 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.13 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.39 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.05 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.87 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.63 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.88 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.11 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.91 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.22 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.58 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  34.54 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  34.54 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.76 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.17 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.75 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  35.11 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  34.15 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  34.59 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.2 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.51 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  34.28 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  34.28 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  34.28 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>