More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2606 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  95.74 
 
 
352 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  100 
 
 
352 aa  695    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  80.4 
 
 
352 aa  565  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  76.99 
 
 
352 aa  549  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  66.47 
 
 
353 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  62.99 
 
 
350 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  64.02 
 
 
348 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  63.1 
 
 
349 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  65.06 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  62.39 
 
 
352 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  65.14 
 
 
357 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  58.64 
 
 
355 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  54.84 
 
 
344 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  50.45 
 
 
347 aa  328  9e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  53.43 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  53.75 
 
 
346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  43.53 
 
 
344 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  41.03 
 
 
377 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  40.11 
 
 
385 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  39.55 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  42.26 
 
 
340 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 
373 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  43.63 
 
 
391 aa  225  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  40.78 
 
 
376 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  37.82 
 
 
373 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  41.39 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  40.51 
 
 
385 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
406 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  41.62 
 
 
375 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  41.62 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 
374 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  42.01 
 
 
344 aa  209  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  36.77 
 
 
385 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  37.15 
 
 
385 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 
385 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.78 
 
 
374 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  37.78 
 
 
381 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  37.78 
 
 
381 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  37.78 
 
 
381 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  37.78 
 
 
381 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  37.78 
 
 
381 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  37.78 
 
 
381 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 
381 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  32.64 
 
 
328 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
348 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  32.09 
 
 
328 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  34.4 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
322 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  29.61 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  28.13 
 
 
405 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  29.1 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  31.19 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  30.3 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
333 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  28.53 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  31.9 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  30.89 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  29.43 
 
 
324 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  28.92 
 
 
317 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.76 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  29.19 
 
 
322 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  28.29 
 
 
350 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 
346 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  27.74 
 
 
359 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  27.9 
 
 
345 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  27.55 
 
 
341 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 
333 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  28.86 
 
 
322 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  27.71 
 
 
346 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  28.4 
 
 
353 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  27.69 
 
 
350 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  29.03 
 
 
322 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  28.04 
 
 
328 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 
353 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  28.43 
 
 
345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  31.11 
 
 
334 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  30.22 
 
 
347 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  28.43 
 
 
345 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  28.43 
 
 
345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  28.43 
 
 
345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  28.43 
 
 
347 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.14 
 
 
350 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  28.19 
 
 
322 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  30.07 
 
 
327 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3278  monosaccharide-transporting ATPase  30.35 
 
 
334 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.990654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  27.27 
 
 
319 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  26.97 
 
 
357 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 
355 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  30.3 
 
 
311 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  27.36 
 
 
348 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  30.3 
 
 
311 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  27.96 
 
 
336 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
342 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  27.24 
 
 
342 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  27.24 
 
 
334 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
354 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  27.11 
 
 
339 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  28.26 
 
 
312 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  28.4 
 
 
326 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  31.75 
 
 
354 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>