More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1712 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  100 
 
 		 344 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  80.77 
 
 		 342 aa  494  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  67.41 
 
 		 346 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  58.46 
 
 		 353 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  54.73 
 
 		 352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  54.84 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  51.47 
 
 		 352 aa  352  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  56.79 
 
 		 350 aa  348  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  51.64 
 
 		 352 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  54.46 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  52.91 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  50.74 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  54.71 
 
 		 353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  50.44 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  51.83 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  47.32 
 
 		 340 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  47.51 
 
 		 377 aa  271  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  43.77 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  45.69 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  50.77 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  44.17 
 
 		 373 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  44.11 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  44.2 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  44.2 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  42.47 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  40.66 
 
 		 374 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 406 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  42.82 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  43.37 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  43.37 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  43.37 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  43.37 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  43.37 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  43.37 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  43.37 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  42.82 
 
 		 381 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  43.96 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  40.93 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.83 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  31.64 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.64 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  31.53 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  30.13 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 		 345 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  31.79 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  30.35 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.46 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  30.09 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  31.29 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  29.2 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.29 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  30.33 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  29.84 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  28.66 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  31.7 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.59 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  29.46 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.13 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  29.77 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>