More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2108 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  100 
 
 		 354 aa  668    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.77 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.88 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  38.24 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.61 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  41.79 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  39.24 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  37.26 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 835 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  39 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  35.04 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.18 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 353 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.18 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  38.01 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.24 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.63 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.28 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.89 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  32.8 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 		 311 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.52 
 
 		 311 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.45 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  35.51 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.83 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.15 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.15 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.41 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.63 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  36.83 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.15 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.54 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  39.05 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  37.08 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.03 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  36.57 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.59 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  33.22 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  33.22 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  37.96 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.63 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  37.2 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.29 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  39.69 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  36.73 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  37.59 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 341 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.73 
 
 		 347 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>