More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1300 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  99.73 
 
 
375 aa  724    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 
375 aa  728    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  92.02 
 
 
376 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  75.41 
 
 
373 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  71.82 
 
 
373 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  70.64 
 
 
373 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  68.92 
 
 
385 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  63.44 
 
 
391 aa  431  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  51.06 
 
 
385 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  49.47 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  50.13 
 
 
373 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.8 
 
 
385 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  52 
 
 
385 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  52.16 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  49.47 
 
 
374 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  52.43 
 
 
374 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  52.43 
 
 
381 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  52.43 
 
 
381 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  52.43 
 
 
381 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  52.43 
 
 
381 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  52.43 
 
 
381 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  52.43 
 
 
381 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  51.74 
 
 
385 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  48.9 
 
 
340 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  47.79 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  48.14 
 
 
344 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  42.82 
 
 
377 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  46.67 
 
 
346 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  44.2 
 
 
344 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  46.43 
 
 
342 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  39.84 
 
 
347 aa  222  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
352 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
349 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  39.95 
 
 
348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  41.71 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  39.73 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  41.62 
 
 
352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
350 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
352 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
353 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  41.24 
 
 
357 aa  185  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  31.55 
 
 
328 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  30.59 
 
 
328 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  38 
 
 
348 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  31.79 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.73 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.81 
 
 
345 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.28 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.28 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  29.97 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 
346 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.68 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  30.29 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.46 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  28.44 
 
 
329 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
332 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.74 
 
 
336 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.4 
 
 
347 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
334 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  31.61 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  31.61 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  29.29 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  28.77 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.6 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  27.68 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  28.05 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  29.92 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  30.03 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
334 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
334 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  32.31 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  31.34 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  30.99 
 
 
334 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  32.9 
 
 
393 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  30.75 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  30.05 
 
 
332 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  30.14 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  27.3 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  29.61 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  31.36 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  33.15 
 
 
394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  29.23 
 
 
335 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  30.64 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31 
 
 
322 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.53 
 
 
330 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.53 
 
 
330 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
330 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  30.89 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.57 
 
 
309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  30.23 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  29.78 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  30.14 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1426  monosaccharide-transporting ATPase  29.44 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>