More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2317 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  100 
 
 		 355 aa  701    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  60.56 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  58.53 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  61.01 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  58.82 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  58.64 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  57.74 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  60.54 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  55.65 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  57.78 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  58.64 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  56.75 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  50.44 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  49.26 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  48.66 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  46.91 
 
 		 347 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  37.37 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  42.25 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  37.47 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 385 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  37.47 
 
 		 375 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  33.25 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  38 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  35.98 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  35.97 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.15 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  35.15 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  36.22 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  35.15 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  35.15 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  35.15 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  35.15 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  35.15 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  30.95 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.97 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  26.73 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  28.92 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  30.63 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.65 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.13 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  26.52 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.39 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  28.98 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  29.64 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  29 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  26.69 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  28.39 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  29.49 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  26.37 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  28.25 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  29.26 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.17 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  28.18 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  26.96 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  33.83 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  28.24 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  30.17 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  26.97 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  29.76 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  26.54 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  29.11 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  28.48 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  29.43 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 329 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  28.96 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>