More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4536 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  100 
 
 		 357 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  71.17 
 
 		 353 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  66.67 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  63.48 
 
 		 352 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  63.94 
 
 		 353 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  61.65 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  58.87 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  65.14 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  59.72 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  59.08 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  63.66 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  55.13 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  51.83 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  51.46 
 
 		 347 aa  328  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  51.21 
 
 		 346 aa  325  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  51.23 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  40.77 
 
 		 377 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  43.2 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  38.51 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  44.95 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 373 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  35.04 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  38.92 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  35.75 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 381 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.54 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  35.54 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  35.54 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  35.54 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  35.54 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  35.54 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  35.54 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 385 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.12 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.89 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  28.91 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  28.61 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 328 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.67 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  28.2 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  31.2 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.7 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  27.76 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  32.4 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.69 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  31.69 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  31.69 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  29.05 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  32.88 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  29.39 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.44 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.86 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  30.26 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  28.29 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.79 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  25.14 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  26.18 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  30.14 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  31.12 
 
 		 322 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  27.9 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>