More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4348 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  100 
 
 
348 aa  654    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.32 
 
 
330 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
330 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 
330 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.92 
 
 
312 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  41.77 
 
 
328 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 
835 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.85 
 
 
333 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.14 
 
 
310 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.8 
 
 
310 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  38.27 
 
 
337 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  39.64 
 
 
337 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.36 
 
 
306 aa  196  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
309 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  39.54 
 
 
340 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  37.07 
 
 
322 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  44.24 
 
 
327 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 
311 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.79 
 
 
311 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41.12 
 
 
311 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 
311 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.79 
 
 
311 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.24 
 
 
334 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.46 
 
 
311 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.14 
 
 
336 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.46 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.46 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.43 
 
 
342 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.33 
 
 
334 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.33 
 
 
334 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.88 
 
 
345 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  40.86 
 
 
342 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  37.61 
 
 
325 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  40.86 
 
 
342 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  40.86 
 
 
342 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  38.44 
 
 
322 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 
311 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
383 aa  186  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  37.12 
 
 
319 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  37.24 
 
 
329 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  39 
 
 
320 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  40.12 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  39.87 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  39.87 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  39.87 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  39.87 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  39.87 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40.45 
 
 
333 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.38 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 
335 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.1 
 
 
322 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.89 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  39.29 
 
 
324 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.01 
 
 
324 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  39.66 
 
 
321 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.2 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  43.08 
 
 
324 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
311 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  40.56 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.67 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  38.39 
 
 
322 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
342 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
334 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 
346 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.02 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  38.97 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  40.54 
 
 
336 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 
346 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  43.3 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.72 
 
 
323 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  43.3 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.07 
 
 
334 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  42.02 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  38.92 
 
 
321 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
337 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.68 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  43.3 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  43.3 
 
 
334 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  42.02 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  42.02 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.17 
 
 
328 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  38.73 
 
 
310 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  36.93 
 
 
328 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.07 
 
 
327 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.96 
 
 
327 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>