More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9126 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9126  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  100 
 
 		 350 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 322 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  37.61 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 328 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37 
 
 		 311 aa  166  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  37 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.34 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.09 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.09 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.09 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.78 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  37.66 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  35.41 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35.58 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.35 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1375  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.01 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 355 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 405 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.78 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.25 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  36.18 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.76 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  34.76 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.65 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.15 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  32.91 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.78 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  34.08 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.78 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.79 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.11 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>