108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4855 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  100 
 
 		 599 aa  1244    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  43.73 
 
 		 335 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  42.68 
 
 		 327 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  40.06 
 
 		 337 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  40.06 
 
 		 337 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  42.62 
 
 		 337 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  38.65 
 
 		 307 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.61 
 
 		 340 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  35.71 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  37.13 
 
 		 354 aa  198  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  69.93 
 
 		 203 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  33.56 
 
 		 384 aa  194  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  34.85 
 
 		 353 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  34.59 
 
 		 353 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  36.63 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  36.51 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  35.36 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  36.15 
 
 		 707 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 706 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 704 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3680  strictosidine synthase  31.37 
 
 		 301 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105851  normal  0.330915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3023  hypothetical protein  33.46 
 
 		 263 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37040  hypothetical protein  31.46 
 
 		 266 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.567291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  30.58 
 
 		 357 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  31.14 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.32 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.34 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  23.85 
 
 		 280 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  23.19 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  25.67 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  25.22 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  25.43 
 
 		 366 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  27.44 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  27.44 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  27.44 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  25.13 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.05 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5021  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  22.22 
 
 		 312 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  29.05 
 
 		 367 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.6 
 
 		 306 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.53 
 
 		 313 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  25.67 
 
 		 302 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  26.24 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  31.21 
 
 		 305 aa  55.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  28.12 
 
 		 332 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  23.68 
 
 		 322 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  26.54 
 
 		 308 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  23.53 
 
 		 313 aa  54.3  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.53 
 
 		 313 aa  54.3  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.53 
 
 		 309 aa  53.9  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  24.28 
 
 		 363 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.6 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2553  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  21.12 
 
 		 338 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  24.74 
 
 		 313 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  23.26 
 
 		 307 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.99 
 
 		 318 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.99 
 
 		 318 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.41 
 
 		 307 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  23.7 
 
 		 372 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  28.66 
 
 		 323 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  23.67 
 
 		 338 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  26.35 
 
 		 304 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  26.83 
 
 		 304 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  24.64 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  26.34 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.04 
 
 		 273 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  24.14 
 
 		 357 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  26.39 
 
 		 307 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  26.39 
 
 		 307 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  23.28 
 
 		 312 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.87 
 
 		 282 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  26.06 
 
 		 316 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25 
 
 		 279 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  23.9 
 
 		 312 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  20.53 
 
 		 368 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  25.45 
 
 		 304 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  23.61 
 
 		 304 aa  47.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  23.81 
 
 		 316 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  22.4 
 
 		 316 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  22 
 
 		 315 aa  47  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  25.77 
 
 		 323 aa  47  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  24.34 
 
 		 299 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  19.42 
 
 		 353 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  22.4 
 
 		 313 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  22.4 
 
 		 313 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  23.01 
 
 		 339 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1822  gluconolactonase  25.84 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  22.4 
 
 		 313 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  22.4 
 
 		 313 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.8 
 
 		 299 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  25.3 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  24.34 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  24.74 
 
 		 304 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  23.08 
 
 		 281 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  24.21 
 
 		 350 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  24.1 
 
 		 325 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  24.12 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.35 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.83 
 
 		 298 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>