288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6418 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  89.29 
 
 
308 aa  577  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  65.57 
 
 
310 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  61.02 
 
 
299 aa  362  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  58.31 
 
 
304 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  56.67 
 
 
303 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  54.3 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  53.31 
 
 
304 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  56.38 
 
 
306 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  55.7 
 
 
307 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  55.56 
 
 
302 aa  329  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  55.07 
 
 
302 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  56.04 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  54 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  55.15 
 
 
303 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  54.82 
 
 
303 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  52.49 
 
 
313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  52.49 
 
 
313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  52.49 
 
 
313 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  52.49 
 
 
316 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  52.49 
 
 
313 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  53.38 
 
 
296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  50.32 
 
 
324 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  51.59 
 
 
353 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  49 
 
 
316 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  48.04 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  50.17 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  48.21 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.49 
 
 
300 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  48.5 
 
 
312 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  47.73 
 
 
350 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  48.83 
 
 
304 aa  278  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  49.19 
 
 
315 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  47.57 
 
 
357 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  46.75 
 
 
352 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  47.51 
 
 
316 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.64 
 
 
368 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  47.08 
 
 
332 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  43.52 
 
 
362 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  47.45 
 
 
281 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  44.23 
 
 
366 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  47.28 
 
 
323 aa  248  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.44 
 
 
407 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  46.15 
 
 
286 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  46.08 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  45.51 
 
 
371 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  46.08 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  46.91 
 
 
281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  43.49 
 
 
363 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  41.25 
 
 
343 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  44.44 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  44.26 
 
 
328 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  42.76 
 
 
295 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  41.4 
 
 
372 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.28 
 
 
415 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.82 
 
 
406 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  45.2 
 
 
281 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  42.56 
 
 
314 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  43.42 
 
 
287 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  40 
 
 
325 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  35.5 
 
 
338 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  34.85 
 
 
338 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  38.23 
 
 
533 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  36.39 
 
 
338 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  35.02 
 
 
338 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  34.29 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  38.71 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.86 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.76 
 
 
318 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  40.48 
 
 
247 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  36.33 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  34.09 
 
 
545 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  64.04 
 
 
131 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  64.04 
 
 
131 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  44.09 
 
 
183 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  44.09 
 
 
183 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  33.01 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  28.57 
 
 
398 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.64 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  33.12 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.07 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.44 
 
 
302 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  29.1 
 
 
353 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  29.49 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  37.31 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.03 
 
 
334 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.42 
 
 
581 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28 
 
 
579 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.41 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.41 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.74 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04004  lactonohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08990)  25.68 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162257  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.25 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.3 
 
 
197 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.37 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.37 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.37 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.84 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  28.41 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>