More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5316 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  100 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  78.95 
 
 		 304 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  79.28 
 
 		 304 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  73.2 
 
 		 306 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  71.05 
 
 		 303 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  69.08 
 
 		 303 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  63.73 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  63.05 
 
 		 296 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  58.94 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  61.54 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  60.54 
 
 		 299 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  57.95 
 
 		 308 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  56.67 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  58.67 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  56.33 
 
 		 304 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  58.67 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.92 
 
 		 300 aa  334  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  56.81 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  57.43 
 
 		 313 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  53.02 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  55.88 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  56.52 
 
 		 322 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  56 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  56 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  54.85 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  56 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  56 
 
 		 313 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  56 
 
 		 313 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  55.15 
 
 		 316 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  55.28 
 
 		 302 aa  308  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  54.18 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  51.62 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  49.51 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  49.51 
 
 		 357 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  50.16 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  49.04 
 
 		 350 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  47.13 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  48.5 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.46 
 
 		 368 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  51.46 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  45.37 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  49.1 
 
 		 286 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  49.65 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  51.46 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  46.82 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  48.94 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  48.58 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  48.81 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  45.37 
 
 		 363 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.53 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  46.34 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  49.65 
 
 		 287 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  44.52 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  45.19 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  44.84 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  43 
 
 		 338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  41.45 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  40.13 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  40.79 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  43.33 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  43.94 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.98 
 
 		 415 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  41.97 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.46 
 
 		 406 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  40.75 
 
 		 533 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  43.32 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  39.72 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  36.72 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  40.07 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.03 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  38.8 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  36.69 
 
 		 545 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  37.27 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  49.73 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  49.73 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  37.97 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.1 
 
 		 340 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  64.6 
 
 		 131 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  64.6 
 
 		 131 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.26 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.8 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  29.19 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  33.79 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.13 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.99 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  36.82 
 
 		 477 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.96 
 
 		 581 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.21 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  30.28 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  31.82 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  31.58 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  30.83 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.7 
 
 		 569 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.07 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.07 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.22 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.22 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  30.65 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.61 
 
 		 197 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.19 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>