213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3561 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  100 
 
 
340 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  49.19 
 
 
318 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  44.08 
 
 
342 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  42.23 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  37.06 
 
 
339 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  37.5 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  42.11 
 
 
287 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  41.75 
 
 
281 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  30.95 
 
 
398 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  33.96 
 
 
340 aa  175  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  34.19 
 
 
545 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  32.17 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  32.17 
 
 
352 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  32.57 
 
 
303 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  32.9 
 
 
316 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  31.56 
 
 
357 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  30.34 
 
 
306 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  33.02 
 
 
324 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  30.12 
 
 
304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  30.1 
 
 
303 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  29.43 
 
 
296 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  29.63 
 
 
304 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  29.94 
 
 
302 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  30.25 
 
 
303 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  32.31 
 
 
315 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  31.63 
 
 
312 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  34.13 
 
 
332 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  32.2 
 
 
286 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  31.91 
 
 
338 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  31.65 
 
 
281 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  33.22 
 
 
322 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  30.99 
 
 
313 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  31.15 
 
 
338 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  30.45 
 
 
313 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  30.99 
 
 
316 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  30.99 
 
 
313 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  30.45 
 
 
313 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  32.24 
 
 
362 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  29.72 
 
 
366 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  30.99 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  33.22 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  30.64 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  31.94 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  33.01 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  27.88 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  28.53 
 
 
316 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  29.15 
 
 
299 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  28.93 
 
 
304 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.77 
 
 
300 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  29.25 
 
 
304 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  31.68 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  29.26 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  31.63 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  29.26 
 
 
533 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  30.28 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  30.43 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  28.33 
 
 
363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  30.07 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  30.59 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  27.67 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  28.66 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  28.34 
 
 
307 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  28.57 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  29.18 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.22 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  26.99 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  28.39 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  26.7 
 
 
338 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  29.49 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.81 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.81 
 
 
415 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.87 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  30.37 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  30.84 
 
 
371 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  27.39 
 
 
343 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.03 
 
 
306 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.01 
 
 
406 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.04 
 
 
307 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.63 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.95 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.95 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.95 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.26 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.26 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  28.7 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.45 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  26.8 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.72 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  26.27 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.94 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.94 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  27.22 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  26.96 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  29.57 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.7 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.61 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  31.25 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  31.25 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.19 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>