272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3888 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  100 
 
 
281 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  96.09 
 
 
281 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  79.34 
 
 
286 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  52.22 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  50.71 
 
 
304 aa  292  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  51.46 
 
 
303 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  49.08 
 
 
306 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  48.73 
 
 
303 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  47.99 
 
 
304 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  47.46 
 
 
304 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  48.36 
 
 
303 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  44.89 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  48.91 
 
 
308 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  47.45 
 
 
308 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  45.74 
 
 
310 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  46.91 
 
 
296 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  44.89 
 
 
299 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.57 
 
 
310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  44.89 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  44.93 
 
 
307 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  41.72 
 
 
327 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  44.93 
 
 
307 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.8 
 
 
300 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  43.06 
 
 
325 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  43.75 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  41.46 
 
 
315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  41.88 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  45.26 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  41.84 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  39.42 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  41.2 
 
 
332 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  38.89 
 
 
362 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  43.01 
 
 
313 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  41.75 
 
 
316 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  43.01 
 
 
313 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  40.56 
 
 
312 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  42.66 
 
 
316 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  40.21 
 
 
353 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  42.66 
 
 
313 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  39.7 
 
 
323 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  42.66 
 
 
313 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  41.07 
 
 
338 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  44.16 
 
 
287 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  39.05 
 
 
328 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  40.78 
 
 
338 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  41.05 
 
 
313 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  43.22 
 
 
314 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  40.91 
 
 
312 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  41.05 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  36.65 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  39.04 
 
 
350 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  35.94 
 
 
338 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  39.58 
 
 
324 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.54 
 
 
368 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  37.33 
 
 
357 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  37.83 
 
 
366 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  38.36 
 
 
352 aa  185  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  37.34 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.88 
 
 
318 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  39.92 
 
 
247 aa  175  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.12 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  37.05 
 
 
372 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  37.16 
 
 
351 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  34.71 
 
 
371 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.99 
 
 
406 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  37.2 
 
 
339 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.99 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.27 
 
 
545 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.5 
 
 
407 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  34.8 
 
 
334 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.3 
 
 
415 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  34.66 
 
 
533 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  33.81 
 
 
343 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  31.65 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  30.77 
 
 
340 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  34.19 
 
 
353 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  40.88 
 
 
183 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  40.88 
 
 
183 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.18 
 
 
306 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.27 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  24.93 
 
 
398 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28 
 
 
334 aa  99  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.1 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  44.55 
 
 
131 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  44.55 
 
 
131 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  32.34 
 
 
477 aa  87  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.17 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.17 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.18 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.18 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  27.27 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.2 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.09 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.09 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.35 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  32.05 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  42.67 
 
 
123 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04004  lactonohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08990)  28.72 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162257  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  29.01 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.79 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>