More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3774 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  91.42 
 
 
303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  73.67 
 
 
306 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  71.05 
 
 
304 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  70.07 
 
 
304 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  71.05 
 
 
303 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  59.06 
 
 
304 aa  374  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  61.69 
 
 
296 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  58.98 
 
 
302 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  58.8 
 
 
310 aa  351  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  56.25 
 
 
312 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  56.04 
 
 
299 aa  341  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  57.19 
 
 
307 aa  341  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  56.19 
 
 
307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  54.85 
 
 
304 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  57.24 
 
 
308 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  54.25 
 
 
315 aa  328  7e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  54.82 
 
 
308 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  54.28 
 
 
316 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  54.28 
 
 
313 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  54.28 
 
 
313 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  53.02 
 
 
304 aa  322  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  54.28 
 
 
313 aa  321  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  54.28 
 
 
313 aa  321  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  55.37 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  54.1 
 
 
322 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  56.57 
 
 
302 aa  318  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  54.25 
 
 
312 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  53.92 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  51.64 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  50.85 
 
 
300 aa  311  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  50.66 
 
 
332 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  49.52 
 
 
324 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  48.23 
 
 
350 aa  288  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  48.55 
 
 
310 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  50.32 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  45.87 
 
 
362 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  48.08 
 
 
357 aa  278  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  46.65 
 
 
352 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.5 
 
 
368 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  48.73 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  47.84 
 
 
286 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  47.04 
 
 
323 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  47.83 
 
 
281 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  44.13 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  43.22 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  47.74 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  47.74 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.81 
 
 
407 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  42.9 
 
 
372 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  44.23 
 
 
327 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  48.56 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  42.77 
 
 
371 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  48.58 
 
 
281 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  43.99 
 
 
295 aa  237  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.2 
 
 
415 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  42.05 
 
 
314 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  39.39 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  38.72 
 
 
338 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  39.46 
 
 
338 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  38.85 
 
 
338 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  40.2 
 
 
343 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  38.36 
 
 
325 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.43 
 
 
406 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  39.86 
 
 
533 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  39.01 
 
 
334 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  41.2 
 
 
247 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  38.66 
 
 
318 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  39.93 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.96 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  37.37 
 
 
351 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  47.83 
 
 
183 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  47.83 
 
 
183 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  36.24 
 
 
545 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  33.12 
 
 
339 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  62.71 
 
 
131 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  62.71 
 
 
131 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.25 
 
 
340 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.45 
 
 
306 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  33.12 
 
 
340 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  43.89 
 
 
353 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.82 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  28.74 
 
 
398 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.49 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.31 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  34.33 
 
 
477 aa  116  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  31.32 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.34 
 
 
294 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.33 
 
 
581 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  30.3 
 
 
294 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.24 
 
 
197 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  29.79 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.77 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  29.39 
 
 
291 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30 
 
 
309 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3124  hypothetical protein  46.46 
 
 
103 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  30.38 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  38.94 
 
 
123 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.01 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.01 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>