254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0764 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  100 
 
 
338 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  67.11 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  46.88 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  46.29 
 
 
338 aa  309  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  43 
 
 
303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  42.86 
 
 
304 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  42.18 
 
 
304 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  40.34 
 
 
306 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  39.87 
 
 
302 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  40.78 
 
 
325 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  39.46 
 
 
303 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  40.07 
 
 
303 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  41.07 
 
 
281 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  40.43 
 
 
286 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  37.54 
 
 
310 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  38.85 
 
 
304 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  40 
 
 
281 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  38.44 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  38.19 
 
 
295 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  40.86 
 
 
327 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  37.5 
 
 
296 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.77 
 
 
300 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.34 
 
 
310 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  38.35 
 
 
312 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  34.69 
 
 
328 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  34.35 
 
 
328 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  36.69 
 
 
316 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  33.67 
 
 
323 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  39.43 
 
 
322 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  39.15 
 
 
313 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  36.39 
 
 
308 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  36.3 
 
 
304 aa  185  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  36.39 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  36.27 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  36.56 
 
 
299 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  37.46 
 
 
312 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  38.08 
 
 
307 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  36.36 
 
 
316 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  37.72 
 
 
307 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  38.1 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  36.45 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  38.83 
 
 
281 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  38.21 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  38.21 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  38.21 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  38.21 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  38.21 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  34.66 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  36.92 
 
 
332 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  35.62 
 
 
350 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  39.06 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  34.16 
 
 
351 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  35.31 
 
 
318 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  34.57 
 
 
342 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  34.3 
 
 
324 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  33.23 
 
 
357 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.42 
 
 
407 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  32.17 
 
 
352 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  35.01 
 
 
353 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.1 
 
 
368 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  34.7 
 
 
340 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  32.94 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  34.64 
 
 
366 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  33.44 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  32.85 
 
 
372 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.62 
 
 
340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.12 
 
 
533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  31.36 
 
 
545 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.52 
 
 
415 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29 
 
 
406 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.22 
 
 
306 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.36 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  30.77 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  33.12 
 
 
340 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  31.21 
 
 
343 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.57 
 
 
334 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  33.88 
 
 
353 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.08 
 
 
334 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.8 
 
 
302 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.7 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  26.63 
 
 
398 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  33.9 
 
 
477 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  39.82 
 
 
131 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  39.82 
 
 
131 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  35.76 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  35.76 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.83 
 
 
581 aa  82.4  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.67 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.69 
 
 
579 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.71 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.37 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  30.11 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.73 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.45 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.41 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.13 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.64 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  23.89 
 
 
280 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.34 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3124  hypothetical protein  37.23 
 
 
103 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>