239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0646 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  100 
 
 
280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.69 
 
 
312 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.46 
 
 
279 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3590  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
281 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.53 
 
 
307 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.03 
 
 
307 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  30.19 
 
 
304 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.48 
 
 
298 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.48 
 
 
298 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.77 
 
 
306 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.75 
 
 
318 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.75 
 
 
318 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.77 
 
 
309 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  31.65 
 
 
307 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.01 
 
 
306 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.62 
 
 
313 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.62 
 
 
313 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.23 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.28 
 
 
307 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.46 
 
 
309 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.01 
 
 
306 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.13 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  29.87 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  25.52 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  28.08 
 
 
323 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.22 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  26.13 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.41 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  27.97 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  25.44 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.64 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2553  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.34 
 
 
338 aa  78.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.67 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  27.3 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.17 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.61 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.52 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  24.37 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  26.14 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  24.91 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.22 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.39 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.79 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  27.06 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.67 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  22.12 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  29.09 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  23.1 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  27.72 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  29.33 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  24.41 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  26.18 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  26.33 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  24.02 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  23.84 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  23.84 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.63 
 
 
533 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  27.2 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  24.29 
 
 
353 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  26.57 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  29.58 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  23.42 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2303  gluconolactonase  24.39 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  21.5 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  24 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.08 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  24.65 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  25.8 
 
 
350 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  23.44 
 
 
304 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  23.85 
 
 
599 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  24.91 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.31 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  23.89 
 
 
338 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  23.6 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  27.49 
 
 
327 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1567  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.38 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.382911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.1 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  23.25 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  25.19 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  26.62 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  23.9 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  26.56 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  23.9 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.43 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  23.9 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  25.28 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  26.6 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  23.84 
 
 
352 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  23.28 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  27.09 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  22.94 
 
 
307 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  27.6 
 
 
354 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  22.62 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  24.91 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  26.61 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.9 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1696  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.24 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  22.88 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>