293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0714 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  74.26 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  67.85 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  67.85 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.17 
 
 		 309 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  63.84 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.17 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  63.84 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  63.84 
 
 		 313 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  64.5 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  58.59 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  54.28 
 
 		 307 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  53.09 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.83 
 
 		 298 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.83 
 
 		 298 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  55.26 
 
 		 306 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  52.81 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.44 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  46.84 
 
 		 304 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  46.82 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00220  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  44.26 
 
 		 594 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.22 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  31.03 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.48 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  31.25 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  33 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.69 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  29.74 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  29.9 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.9 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.35 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.21 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  29.63 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.1 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.37 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  30.67 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.76 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.93 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  29.33 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.37 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.37 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.94 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.02 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  30.88 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.77 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  28.62 
 
 		 545 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  30.58 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.35 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  32.53 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 		 579 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  27.6 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  30.83 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  28.17 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  29.93 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  28.94 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  28.72 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  29.47 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  28.74 
 
 		 352 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  29.32 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.12 
 
 		 581 aa  79  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.46 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  28.73 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  29.64 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  27.24 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  29.6 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  27.2 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  29.44 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.1 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  29.63 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  29.63 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  28.57 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  31.94 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  28.31 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  27.76 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.31 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  30.43 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.52 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  27.82 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.52 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  28.09 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  28.24 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  28.52 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  28.92 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.22 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.71 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  27.97 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  26.81 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.64 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  28.06 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  29.72 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.51 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.53 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  29.93 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  28.92 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  27.95 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  28.92 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.72 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  31.44 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>