159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2315 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  100 
 
 
325 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  83.69 
 
 
324 aa  577  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  83.69 
 
 
324 aa  577  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2735  hypothetical protein  55.47 
 
 
127 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  33.04 
 
 
304 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1696  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.77 
 
 
346 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.84 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  30.59 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  28.26 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.71 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.71 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.54 
 
 
313 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.67 
 
 
307 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.94 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.94 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.76 
 
 
307 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.82 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.82 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.19 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.54 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.87 
 
 
306 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  27.21 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.4 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.71 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  28.24 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.79 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.85 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.07 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.07 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.43 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  26.88 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.21 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.89 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.62 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.09 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01688  calcium homeostasis protein Regucalcin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08610)  25 
 
 
442 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.861839  normal  0.297769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  25.1 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  26.48 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.71 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.42 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.89 
 
 
299 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.96 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  27.17 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.1 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  27.09 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.13 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  25.23 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  24.08 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  29.46 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  24.77 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  24.77 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  30.3 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.9 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  28.69 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  22.94 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  30.52 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  28.67 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.75 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  24.86 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  24.86 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.43 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  27.86 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0183  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.92 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  24.21 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  23.64 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  24.64 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.68 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  27.18 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  25.42 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  34.04 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  22.17 
 
 
288 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  22.17 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  24.17 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  23.4 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.11 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.56 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0165  gluconolactonase  26.15 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  23.33 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  25.93 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.04 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.66 
 
 
579 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  27.94 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  21.49 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.79 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  25 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.17 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724481  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  22.71 
 
 
289 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.34 
 
 
301 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  27.27 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.34 
 
 
301 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.31 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.06 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  26.09 
 
 
357 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  23.36 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  30.95 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  22.92 
 
 
304 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0435  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.16 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 
304 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>