64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2735 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2735  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  258  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  55.47 
 
 
325 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  56.25 
 
 
324 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  56.25 
 
 
324 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  33.04 
 
 
316 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1696  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.2 
 
 
346 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.13 
 
 
305 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0435  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.82 
 
 
294 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  33.87 
 
 
352 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  29.46 
 
 
288 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.78 
 
 
275 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1625  senescence marker protein-30 family protein  25.78 
 
 
310 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0183  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.95 
 
 
316 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  29.09 
 
 
292 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  34.68 
 
 
353 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.62 
 
 
290 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.03 
 
 
296 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  31.62 
 
 
315 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.55 
 
 
301 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0165  gluconolactonase  26.96 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.55 
 
 
301 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  26.36 
 
 
300 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  30.4 
 
 
357 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.55 
 
 
286 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  33.68 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.77 
 
 
303 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.39 
 
 
309 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1810  senescence marker protein-30 family protein  24.53 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.96 
 
 
305 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.69 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.69 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0622  senescence marker protein-30 family protein  24.53 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1143  gluconolactonase  24.53 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2356  senescence marker protein-30 family protein  24.53 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0845  senescence marker protein-30 family protein  24.53 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 
366 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1058  senescence marker protein-30 family protein  24.53 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.1 
 
 
318 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.08 
 
 
307 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  26.26 
 
 
395 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  28.46 
 
 
363 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.72 
 
 
302 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  29.57 
 
 
312 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.97 
 
 
303 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  26.26 
 
 
395 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.75 
 
 
312 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  25.69 
 
 
280 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  28.32 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5473  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.55 
 
 
299 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.09 
 
 
317 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  31.45 
 
 
350 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.26 
 
 
299 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.72 
 
 
301 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  28.95 
 
 
308 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  30.61 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.53 
 
 
283 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  35.71 
 
 
322 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  29.55 
 
 
280 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  29.84 
 
 
305 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  29.49 
 
 
308 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.66 
 
 
281 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3944  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.78 
 
 
312 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.26 
 
 
291 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.42 
 
 
295 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>