More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1381 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
286 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.75 
 
 
296 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.03 
 
 
318 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  39.93 
 
 
315 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.85 
 
 
280 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.54 
 
 
569 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  38.29 
 
 
289 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.97 
 
 
312 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  40 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.91 
 
 
311 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  36.9 
 
 
291 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  37.97 
 
 
280 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.39 
 
 
287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2637  senescence marker protein-30 family protein  36.7 
 
 
290 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  36.67 
 
 
280 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.51 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  33.59 
 
 
288 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  34.24 
 
 
288 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.64 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.31 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0604  gluconolactonase  41.36 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0638316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.46 
 
 
309 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.88 
 
 
281 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  35.63 
 
 
279 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.86 
 
 
292 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  39.11 
 
 
308 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.38 
 
 
288 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2370  senescence marker protein-30 (SMP-30)  35.57 
 
 
290 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.34 
 
 
304 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  34.89 
 
 
546 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.24 
 
 
292 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.67 
 
 
295 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  38.29 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.03 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  40.64 
 
 
295 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  34.23 
 
 
300 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.39 
 
 
302 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4224  gluconolactonase  40.2 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0419  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.83 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  37.24 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  37.68 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  33.2 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  37.13 
 
 
293 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.39 
 
 
300 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2084  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.27 
 
 
300 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.68 
 
 
302 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.39 
 
 
300 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01688  calcium homeostasis protein Regucalcin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08610)  33.08 
 
 
442 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.861839  normal  0.297769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  36.97 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.18 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  35.88 
 
 
295 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.67 
 
 
292 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  34.92 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  36.73 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.47 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  33.72 
 
 
283 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.99 
 
 
293 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.71 
 
 
293 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.92 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.9 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.74 
 
 
302 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  32.71 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  35.68 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  28.21 
 
 
300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.56 
 
 
302 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 
315 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.12 
 
 
301 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  28.26 
 
 
300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.55 
 
 
330 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.12 
 
 
301 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5895  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.27 
 
 
296 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0487304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3944  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.03 
 
 
312 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  27.8 
 
 
300 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.99 
 
 
290 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  27.9 
 
 
303 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.76 
 
 
292 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3876  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.46 
 
 
279 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2099  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.15 
 
 
291 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.78 
 
 
309 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.89 
 
 
300 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  28.06 
 
 
300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  28.87 
 
 
300 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  35.77 
 
 
309 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.67 
 
 
293 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3138  gluconolactonase  37.87 
 
 
279 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  35.56 
 
 
291 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0500  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.84 
 
 
295 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.23 
 
 
574 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0543  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.96 
 
 
295 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  42.94 
 
 
296 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0916  calcium-binding protein regucalcin  32.06 
 
 
293 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  30.63 
 
 
290 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.24 
 
 
309 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.19 
 
 
291 aa  102  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.34 
 
 
296 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1273  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.13 
 
 
297 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.79 
 
 
301 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.58 
 
 
295 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.05 
 
 
280 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.23 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>