285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3831 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  100 
 
 
283 aa  580  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  55.59 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.93 
 
 
280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  55.4 
 
 
281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51450  gluconolactonase  53.31 
 
 
284 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  54.04 
 
 
279 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3876  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.15 
 
 
279 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3138  gluconolactonase  52.8 
 
 
279 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  41.18 
 
 
395 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  41.18 
 
 
395 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  42.46 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3588  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  38.06 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2136  putative gluconolactonase  44.44 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0500  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.22 
 
 
295 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0435  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.49 
 
 
294 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0543  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40 
 
 
295 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0916  calcium-binding protein regucalcin  39.64 
 
 
293 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.43 
 
 
310 aa  188  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.92 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1273  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.95 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.54 
 
 
344 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1433  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.19 
 
 
297 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5895  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.04 
 
 
296 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0487304 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  37.28 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.41 
 
 
304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.89 
 
 
304 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  35.79 
 
 
291 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.23 
 
 
299 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  30.8 
 
 
288 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.33 
 
 
304 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.56 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.97 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.92 
 
 
569 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  29.51 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.28 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  32.87 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.72 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.21 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.43 
 
 
309 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  35.14 
 
 
303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  31.84 
 
 
296 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.29 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1567  senescence marker protein-30 (SMP-30)  33.2 
 
 
294 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.382911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  31.01 
 
 
300 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  34.81 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.69 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.44 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 
292 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.54 
 
 
300 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.71 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  35.46 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.34 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.39 
 
 
574 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
302 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.04 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  33.11 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  30.85 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  36.03 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.03 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  32.96 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  30.31 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  31.21 
 
 
300 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  33 
 
 
294 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0183  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.79 
 
 
316 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  33.09 
 
 
289 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 
546 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  30.5 
 
 
300 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0235  gluconolactonase  34.24 
 
 
323 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  29.17 
 
 
300 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.86 
 
 
292 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0165  gluconolactonase  33.11 
 
 
316 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3342  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.77 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.45 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  31.21 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.17 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.99 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4918  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.95 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117058  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.67 
 
 
330 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  36.68 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  31.97 
 
 
296 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.93 
 
 
574 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  32.45 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.77 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3180  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  28.87 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.56 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.67 
 
 
300 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.08 
 
 
289 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0186  gluconolactonase  32.26 
 
 
311 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.51 
 
 
302 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.67 
 
 
300 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  32.52 
 
 
280 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0479  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.91 
 
 
312 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.45 
 
 
312 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  34.01 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.42 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5473  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.29 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  32.35 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.07 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.14 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>