241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2136 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2136  putative gluconolactonase  100 
 
 
293 aa  593  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  65.07 
 
 
310 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1433  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  57.84 
 
 
297 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  57.14 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  53.47 
 
 
395 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  53.47 
 
 
395 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.12 
 
 
302 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.14 
 
 
335 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1273  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  57.49 
 
 
297 aa  315  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5895  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  56.99 
 
 
296 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0487304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0916  calcium-binding protein regucalcin  53.85 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3588  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  50.34 
 
 
292 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0435  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.33 
 
 
294 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0500  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  49.11 
 
 
295 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0543  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  49.11 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  45.8 
 
 
281 aa  222  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  46.32 
 
 
279 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  44.44 
 
 
283 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.96 
 
 
280 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51450  gluconolactonase  42.81 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3138  gluconolactonase  42.5 
 
 
279 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840697  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3876  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.43 
 
 
279 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.94 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.15 
 
 
304 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.75 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  30.94 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  36.1 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.32 
 
 
285 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  32.89 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  28.57 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  28.57 
 
 
288 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
330 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.71 
 
 
302 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  31 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.57 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.78 
 
 
569 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.63 
 
 
302 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  30.69 
 
 
296 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.96 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0840  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.52 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.56 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3322  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.08 
 
 
294 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  27.78 
 
 
300 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.18 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  27.47 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2637  senescence marker protein-30 family protein  31.4 
 
 
290 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  27.11 
 
 
300 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  26.74 
 
 
300 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  28.12 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.2 
 
 
289 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  27.84 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.55 
 
 
281 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2084  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.21 
 
 
300 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  29.79 
 
 
291 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.41 
 
 
289 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.35 
 
 
300 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.35 
 
 
300 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.5 
 
 
299 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 
293 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.3 
 
 
291 aa  106  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1292  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.23 
 
 
274 aa  106  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.1 
 
 
295 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  26.37 
 
 
300 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2370  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.87 
 
 
290 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25 
 
 
295 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  30.53 
 
 
295 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  29.43 
 
 
291 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 
546 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  27.59 
 
 
308 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.87 
 
 
300 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.47 
 
 
293 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.27 
 
 
294 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  30.77 
 
 
293 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  28.93 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.5 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.27 
 
 
309 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.27 
 
 
292 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.25 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.23 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1567  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.3 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.382911  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.18 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.18 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0419  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.21 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.49 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.85 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.38 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  35.26 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.93 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.12 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2571  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.24 
 
 
299 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233694  normal  0.0110739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.17 
 
 
289 aa  96.7  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.72815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  28.46 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.22 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.68 
 
 
284 aa  95.9  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  32.61 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.61 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  25 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.15 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.93 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.82 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>